Только сейчас утихли споры между приверженцами горизонтальных (лежаков) и вертикальных (стояков) ульев. Однако этот спор не принципиальный, поскольку и тот и другой типы ульев дают возможность семьям развиваться до огромных размеров и делать большие сборы меда, а селекционерам дают прекрасный иллюстративный материал по изменчивости многих хозяйственных признаков пчел при увеличении объема их жилища.
Однако было доказано, что с вертикальными ульями можно работать с большей производительностью (операции производят не рамками, а корпусами) и они больше применимы на крупных пчелофермах, в то время как с лежаками могут работать без особого напряжения даже пожилые люди.
Размеры и качество сотовых ячеек.
Без сотов невозможна жизнь пчелиной семьи: в них пчелы складывают, перерабатывают и хранят кормовые запасы, на поверхности сотов протекают все жизненные процессы семьи и размещается все население улья, в ячейках сотов пчелы выращивают расплод. Насколько размеры ячеек могут влиять на фенотип всех стаз пчелиной семьи, было показано во многих исследованиях, а также многочисленных наблюдениях пчеловодов. При изучении изменчивости рабочих особей двух семей, выведшихся в сотах с более крупными ячейками (светлые соты) и в сотах с мелкими ячейками, в которых вывелось 12 и 16 поколений (темные соты), установлено, что пчелы, которые развились в светлом соте, были крупнее пчел, развившихся в старых сотах, у них был длиннее хоботок и больше наружные размеры тела (экстерьер). Показательно также значительное уменьшение размеров трутней, выращенных пчелами в пчелиных ячейках, что наблюдал на пасеке каждый пчеловод. В этом случае не требуется точных измерений, чтобы увидеть различие между нормальными трутнями, вышедшими из трутневых ячеек, и карликовыми трутнями, вышедшими из пчелиных ячеек.
Велико значение сотов с правильно отстроенными пчелиными ячейками. Исследователями по этому вопросу (Г. Ф. Таранов, 1948) было показано, что при длительных поисках свободных ячеек матка теряет яйца и эти потери составляют до 400—600 яиц в сутки. Насколько серьезно относятся передовые пчеловоды к этой проблеме, свидетельствует опыт известного пчеловода Д. Т. Найчукова (1960), который рекомендует делать браковку сотов даже в том случае, если на одной стороне рамки будет хотя бы с десяток трутневых ячеек или какое-нибудь другое отклонение.
К факторам внешней среды, сильно влияющим на наследственность пчел и тем самым изменяющим их фенотипы, что осложняет селекционный процесс, также относятся обеспеченность пчел водой, освещенность, влажность, наличие или отсутствие патогенных факторов, блуждание пчел и многое другое.